Свою діяльність по забезпеченню державного захисту конкуренції у підприємницькій діяльності в регіоні Вінницьке обласне територіальне відділення Антимонопольного комітету України розпочало з 8 червня 1994 року під керівництвом Довгалюка Павла Миколайовича, який був незмінним очільником Відділення протягом понад 13 років. Заступником голови Відділення призначено Коровія Валерія Вікторовича. За короткий час було сформовано дієздатний колектив, який в успішно освоїв нове на той час антимонопольне законодавство.
Першими були заходи з демонополізації об'єднань по виробництву молочної та м'ясної продукції, активні дії по припиненню порушень законодавства суб'єктами господарювання, органами влади, місцевого самоврядування, які не зважали на вимоги антимонопольного законодавства. Розпочато роботу по дослідженню ринків та веденню Переліку суб'єктів господарювання, які займали монопольне становище на ринках.
З лютого 1997 року заступником голови Відділення призначено Родінкову Ларису Костянтинівну, з листопада 2005 року - Слободянюка Миколу Володимировича.
В період з січня 2008 року до грудня 2010 року Відділення очолював Книш Олександр Іванович. З червня 2011 року головою відділення призначено Слободянюка Миколу Володимировича.
З грудня 2012 року заступником голови Відділення працює Вихованець Олександр Вікторович.
Неоціненний внесок в становлення колективу, його здобутки внесли ветерани Відділення, які вийшли на заслужений відпочинок: Заворотна А.П, Галайчук І.В., Жембровський В.І., Кормщикова С.В., Родінкова Л.К., Волобуєв П.Г., Довгалюк П.М., Коновалюк О.Р., Гулівата Г.М., Самборський І.К., Книш О.І. Добрі традиції підтримують випускники ВУЗів Дороніна О.В., Орленко О.І., Ткачук О.М., Драпак Ю.П., Пудова М.М., Петрук В.Є., Оверчук М.Є., для яких Відділення стало першим місцем роботи.
Стабільно високі показники діяльності підтримують Соловей Н.В., Одобецька В.В., Лісоветченко В.М., Петришин А.М., Сельська С.В., Усков С.В.
Діяльність Відділення відзначено Дипломом Антимонопольного комітету України 1 ступеня, працівники відділення нагороджені 3 відомчими заоохувальними відзнаками Антимонопольного комітету України, 10 Почесними грамотами Комітету, 9 Почесними грамотами обласної державної адміністрації та обласної ради, 12 працівників отримали подяки Комітету. Діяльність голови Відділення Довгалюка П.М. відзначена Вітальним листом Президента України, Почесною грамотою Кабінету Міністрів України.